Koleksi Karya Ilmiah adalah koleksi yang dapat diakses oleh pemustaka yang berkaitan dengan hasil tulisan ilmiah (penelitian) yang dilakukan Civitas Akademika Universitas PGRI Yogyakarta dalam bentuk cetak dan digital.

Koleksi ini digunakan oleh pemustaka sebagai bahan rujukan untuk mengembangkan dan menulis penelitian-penelitian yang baru. Koleksi ini berupa Skripsi, Tesis, dan Disertasi dari Civitas Akademika yang berasal dari berbagai Program Studi yang ada di Universitas PGRI Yogyakarta.

Terdapat 2 jenis koleksi karya ilmiah, yaitu cetak dan digital. Untuk karya ilmiah cetak dapat diakses dengan datang langsung ke Perpustakaan atau dengan mendatangi masing – masing Program Studi di Universitas PGRI Yogyakarta. Untuk karya ilmiah digital dapat diakses di Repository Universitas PGRI Yogyakarta (repository.upy.ac.id)